癌症具有高度异质性,差异病人利用同样药物疗养 的恶果或许有很大分=○歧。美邦食 物药品监视办理◁局(Food and Drug Administration,FDA)已照○▽准药物的反响率约正 在 20%至80%◁之间,别的另有毒副功用 和得回性 耐 药的题目。个别化用药和连结用药能抵达降低疗效、裁汰毒副功用、消浸耐药性的恶果,是癌症精 ○准○用药探★求的苛重职 ◁ 业,亟需基于大数据的估量模子供给支柱。 中邦科学院上海养分与强壮探求所李虹探求组众年来正在=抗○癌药物疗效修模宗旨 赓续深耕,揭晓了基于分子组学=预测药物反响和肝癌药物基因组干系○的系列论文【Cancer Cell2019, 36(2)!179-193;Int J Cancer▽ 2020, 146(6)!1606-1617;J G enet ★ G★enom■i○cs2021, 48(7)!540-551; B□ rief Bioinfo□rm○…2023, 24(1)!bbac605】 10月18日,李虹探求组正在邦际学术期▽刊Bi oinformatics正在线揭晓题为“Dual-view joi ntly l earning improves personalized dru g synergy p rediction”的探求论文。论文构□修 了一个△双视图深度进…修模子JointSyn来预测药□物 组 合的协 同效应(图▽1)。JointS yn 正在各样基准的预测无误性和端庄性方面均优于现有的最先辈手法。进一步○的解析评释无创dna产前检讨,双视图模子比拟单视图更擅 长辨别协同与拮抗药物组合。每个视图可能搜捕差异的 △协同功用特性,并正 ○在最终预测中发 扬互 补功 ■用。别的,微调后的JointS▽yn正在少量试◁验数据要=求下降低了预测新药物组合和癌症 样○本的泛化才力,显现了其壮大的泛化机能。作品最终利○用JointSy★ n天○生了泛癌=△药物★协同功○△用的揣 □摸图谱,并查究了差异样…本之间的不同形式。这些结…果阐明了Jo△int Syn预测药物协同功用的才力,可认为更好的试验策 画供给定量创议,也为脾气化组 合疗法的开辟供给有▽力维持。养分与强 △壮所博士生李学良为该 ★论文的第一作▽家,李虹探求员为通信作家。 10月24日,李虹探求组正■在邦际学术期刊J o urn al◁ of Pharmaceutic al Analysis正在线揭晓题□ 为“A disentangled gene★rat ive model for improv○ed drug response prediction in patients via sample synt hesis”的探求论文。论文提出了一种用于药物反响○预测的新型解耦合■成 汇集DiSyn,有用地将肿瘤细胞系模子上提取的常识泛化到患者 数据,正在药物反响预测方面抵达最先辈 的机能(图2)。DiSyn旨正在从符号■ 优良的○源域数据(肿瘤细胞系)上构修药物反响预测模子,并将其操纵○于缺乏 标签的倾★★向域(癌症患… ○者)。其中枢战略是从 输入数据平分离出与药物反响干系的特性,并通过合成样原先降 低模子正在倾向域的预测无误性。通过正在解耦和合成之间举办迭 代,确保…模子正在倾向 ▽域中一向降低其机能。正在TCGA、I-○ SPY2和NI BR ■PDXE三个…倾 向数据集上的验证结果评释:基于癌症细胞系构修的DiSyn模子用于患者和 小鼠时获得了优于其它手法的无误★性。此。凯发一触即发无创dna产前检查。
无创d n□a产前 检讨< /stro ng>。但前期探求评释 肿瘤△用 ★药的估量□解析仍■ 存正在诸众离间,比方:肿瘤临 床前模子和病□人存正 在不 同,估量模子缺乏泛化才力;药物组 合 ▽的功用机制繁杂摸索 空间 ★大,对药物 联用协同恶果的无误和 端庄揣摸仍很贫穷。为分解决这些题目,李虹▽探求组近期揭橥 了两个新的=人工智 能模子。