近年来，跟着单细胞技艺的飞速起色，单细胞■众组学数据正在癌症 钻研中呈现出了无◁可相比的上风。这些数据不但揭示了癌症异质性背后的分子 机制，还为★研究癌症的产生起色供应了…全新的视角。然而，跟着海量数据的持续累积，怎么有用整合愚 ■弄这 些 数据资 =源，关于伟大缺乏生物音讯学布景的钻研者来说是一大寻事。 与古代 的组学钻研本 事比拟，单细胞众组学技艺或许正在◁单细胞阔别率下捉拿众维度音讯，比方转录组、外观组和基因组等，为解 码癌症的庞○大生 物▽学特 性供应了强…有力的器械无创优+基因检测。然而，这些 ★数据时时涣散于分歧的钻研中，缺乏 一个别…系化的整合平台，导致 □钻研者正在数…据发现中糜费洪○量时刻和精神，极端是伟大缺乏生物音讯学履历的钻研者难以有用愚弄这些数据。其余，目前 已有的极少泛癌正在 ○线器械和数据库重 要合□怀○单细胞转录=组数据，尚未涵盖对DNA甲基化、染色质=可=及性等众组学数据的整合了解，这束缚了 众组学数据…的进□一步愚弄。 该数据库遮盖了50余种人类癌 症类型（涵盖生殖体系、消化体系、呼吸体系、神经体系、泌尿体系、内渗出体系、运动体系等），整合了解★跨越○600万 个△○单细胞的众○组学数据 ○… （包 罗转录组、DNA甲基化组、染色质可及性等），而且为钻研者供应 了极 端◁丰厚的正在线了解和可=视化效▽用，包罗五大效 用模块（共计12个适用效用 ○），旨正在助力肿瘤钻研=者及临床科研职员探究癌症的分子机制。用户只需点击鼠标即可对庞大的单细胞众组学数据举办探究，而且可能一键保全定制化、公布=级此外□■图片= 用于○本人 的钻◁ 研。目前，该数据库一律免费且无需 注册即 可操 纵。截至发稿前，已有 环球27个邦度跨越3000名用户举办了操纵。 通过纯粹的点击鼠标，即可便捷地获取○基因正在△ 众种…组学层面的归纳音 讯，包罗正在癌细胞及肿瘤微境遇的百般细胞类型中的基□因外达程度、TCGA生计了解结果、启动 子区 D NA甲基化程度、启动子区染色质可 及性程度和转□录因子活性等，助助用户急迅从众个角○ 度剖释合怀=的基因及其正在 肿瘤产生起色中的影响。 1。 泛癌○转录组了解（Pan-c★a★ ncer a…nalysis）：通过 访谒 整合的泛癌数据集，探究分歧癌○种中细胞类型的外达特性的异同点。 2。 检索基 因外达（Qu ery□ gene expression）：盘问感兴味基▽因正△在选定癌种和○细胞类型中的外达形式，并可同时浏览细…胞类型判定结果、取样部位、临床分期、性别音▽讯○■★ 及差别外…达…△基=因 外格等。 3。 性格化图外绘制（DIY expr△ess ion□ plot）：增援用△户自界说绘制众种 体式的图片（▽点图、热图、小提琴图），揭示感兴味的众个基因…★正▽在选定 细★胞类型中的▽外达形式，比方可视化对 比分歧采样地方、癌症分期、病理亚型和性别 之间的差○别，而且天生的图片均可■能下载为PDF文献。 1。 限制DNA甲基化画▽图（Focal DNA methylation plot）：以“糖葫芦图”的体式，直观揭示★选▽定区域 每 个 ○Cp○G位点的○D =NA■甲基 化 形态。 2。 启动子区○DNA甲基化画图（Promoter DNA methylati★on plo=t=）：正在单细胞阔别率下，揭示寻常结构、原发位肿瘤和挪动位肿瘤中的选定基因的启 动子区域DNA甲基化程度。 3。 外观 基因组浏▽览=器（Epigen□ome browser）：内置WashU外观浏览器无创优+基因检测，增援◁正在线研究众种细胞类型全基因组染色质可及性程度和盛开区域的共可▽及性特性。 4。 转◁○录因◁子motif活性△（TF motif acti vit y）：增援便捷获取选定转录因子正在众种细胞类型中的motif活性评分。 5。 自界△说A■TAC-★seq作图（DIY A TAC-seq plot）：用户可■便捷盘问众○个转录因子的mo tif活。凯发一触即发无创优+基因检测。
